Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF6Q9Y252 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF6Q9Y252 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF6Q9Y252 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms