Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms