Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF3Q9NUQ8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF3Q9NUQ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms