Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIPAS39Q9H9C1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIPAS39Q9H9C1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPAS39Q9H9C1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPAS39Q9H9C1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms