Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SETD2Q9BYW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SETD2Q9BYW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms