Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF1Q9BXJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C1QTNF1Q9BXJ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QTNF1Q9BXJ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF1Q9BXJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms