Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM106CQ9BVX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM106CQ9BVX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms