Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPNS2Q96L46 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPNS2Q96L46 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPNS2Q96L46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPNS2Q96L46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPNS2Q96L46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms