Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPDL1Q96EA4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDL1Q96EA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms