Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM43Q96BQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM43Q96BQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM43Q96BQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43Q96BQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms