Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSC4DQ8WTU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC4DQ8WTU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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