Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BEST4Q8NFU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BEST4Q8NFU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms