Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF3Q8N9W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF3Q8N9W5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms