Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LTBP4Q8N2S1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
LTBP4Q8N2S1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LTBP4Q8N2S1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTBP4Q8N2S1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms