Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCQ7RTU9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCQ7RTU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
STRCQ7RTU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCQ7RTU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCQ7RTU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms