Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOSTDC1Q6X4U4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOSTDC1Q6X4U4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms