Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP4Q6FHJ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms