Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNS3Q68CZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNS3Q68CZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNS3Q68CZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNS3Q68CZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms