Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MLIPQ5VWP3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLIPQ5VWP3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms