Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BROXQ5VW32 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BROXQ5VW32 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BROXQ5VW32 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms