Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC6Q16204 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC6Q16204 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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