Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JMJD1CQ15652 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
JMJD1CQ15652 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JMJD1CQ15652 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms