Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CIRBPQ14011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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