Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 TDH2YJR009C 999 nt7.41□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 TRR1YDR353W 960 nt7.4□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YGL260WYGL260W 231 nt7.4□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YNL165WYNL165W 1221 nt7.4□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 RDR1YOR380W 1641 nt7.4□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 EFM1YHL039W 1758 nt7.4□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YLL058WYLL058W 1728 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 MPA43YNL249C 1629 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 ICP55YER078C 1536 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 HHY1YEL059W 309 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 IRC7YFR055W 1023 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YGL102CYGL102C 429 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 COQ3YOL096C 939 nt7.39□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 FCY2YER056C 1602 nt7.38□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 PAC10YGR078C 600 nt7.38□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YOR012WYOR012W 414 nt7.38□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 CMR1YDL156W 1569 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 MSC3YLR219W 2187 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YFL052WYFL052W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YCR049CYCR049C 447 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 ERG27YLR100W 1044 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 ADE17YMR120C 1779 nt7.37□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 FET4YMR319C 1659 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 TSR2YLR435W 618 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YOR200WYOR200W 399 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 ATF1YOR377W 1578 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 KIN1YDR122W 3195 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 AGP2YBR132C 1791 nt7.36□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 EDC3YEL015W 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YDR187CYDR187C 519 nt7.35□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 MEU1YLR017W 1014 nt7.35□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 CDC7YDL017W 1524 nt7.35□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 PRP2YNR011C 2631 nt7.35□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YCR041WYCR041W 333 nt7.34□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 PRI1YIR008C 1230 nt7.34□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YAL045CYAL045C 309 nt7.34□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 YBR027CYBR027C 333 nt7.34□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 PGI1YBR196C 1665 nt7.34□□□□□ -1.23
RTP1Q12751 JIP4YDR475C 2631 nt7.33□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YKL102CYKL102C 306 nt7.33□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.33□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 HST2YPL015C 1074 nt7.33□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 MKK1YOR231W 1527 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 RQC1YDR333C 2172 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 SNF4YGL115W 969 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 MHT1YLL062C 975 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YLR112WYLR112W 420 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 CUE4YML101C 354 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 RNH1YMR234W 1047 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 TAE1YBR261C 699 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 TFC6YDR362C 2019 nt7.32□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 GAA1YLR088W 1845 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YFR006WYFR006W 1608 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 NUP57YGR119C 1626 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 VMA3YEL027W 483 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 CUP2YGL166W 678 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 PRE3YJL001W 648 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YMR295CYMR295C 594 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 AIM3YBR108W 2844 nt7.31□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 MSP1YGR028W 1089 nt7.3□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 SMX3YPR182W 261 nt7.3□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 OPT1YJL212C 2400 nt7.29□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 PTC7YHR076W 1032 nt7.29□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 SCS7YMR272C 1155 nt7.29□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 ZWF1YNL241C 1518 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 AIM2YAL049C 741 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YKR045CYKR045C 552 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 MRPL10YNL284C 969 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 LIP5YOR196C 1245 nt7.28□□□□□ -1.24
RTP1Q12751 VBA5YKR105C 1749 nt7.27□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 EXG2YDR261C 1689 nt7.27□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 HSM3YBR272C 1443 nt7.27□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 MHP1YJL042W 4197 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 GPH1YPR160W 2709 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 REC107YJR021C 945 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 SWD1YAR003W 1281 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 FPR3YML074C 1236 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 PEX3YDR329C 1326 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 UIP5YKR044W 1332 nt7.26□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 MRPS28YDR337W 861 nt7.25□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 YKL077WYKL077W 1179 nt7.25□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 OST3YOR085W 1053 nt7.25□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 RPS28AYOR167C 204 nt7.25□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 DAL4YIR028W 1908 nt7.25□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 ACO1YLR304C 2337 nt7.24□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 RSP5YER125W 2430 nt7.23□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 THR1YHR025W 1074 nt7.23□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 ADH5YBR145W 1056 nt7.23□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 GYP8YFL027C 1494 nt7.23□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 TOS2YGR221C 1869 nt7.22□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 SPG5YMR191W 1122 nt7.22□□□□□ -1.25
RTP1Q12751 HPT1YDR399W 666 nt7.21□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 TIF2YJL138C 1188 nt7.21□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 TIF1YKR059W 1188 nt7.21□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 UIP4YPL186C 915 nt7.21□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 SKY1YMR216C 2229 nt7.2□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 ZRT2YLR130C 1269 nt7.2□□□□□ -1.26
RTP1Q12751 SEC62YPL094C 825 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.4 ms