Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 PRI1YIR008C 1230 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 GCN3YKR026C 918 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 OPI8YKR035C 642 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YLL056CYLL056C 897 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 ERG10YPL028W 1197 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SEC62YPL094C 825 nt7.27□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 CDC13YDL220C 2775 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YOX1YML027W 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 RPR1RPR1 369 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 MRPL19YNL185C 477 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 TOS6YNL300W 309 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YHR020WYHR020W 2067 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 PPM2YOL141W 2088 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 GPA1YHR005C 1419 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YCR061WYCR061W 1896 nt7.26□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 MSC3YLR219W 2187 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SPS22YCL048W 1392 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 NMD5YJR132W 3147 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 ATG36YJL185C 882 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 ECM38YLR299W 1983 nt7.25□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 CHS5YLR330W 2016 nt7.24□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 BNS1YGR230W 414 nt7.24□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 CUE4YML101C 354 nt7.24□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 RGT2YDL138W 2292 nt7.24□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YDR415CYDR415C 1125 nt7.23□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 ORM1YGR038W 669 nt7.23□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YJL144WYJL144W 315 nt7.23□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YJL211CYJL211C 444 nt7.23□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 CTF8YHR191C 402 nt7.22□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 YJL163CYJL163C 1668 nt7.22□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 LAT1YNL071W 1449 nt7.21□□□□□ -1.25
NEW1Q08972 STT3YGL022W 2157 nt7.21□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YPT1YFL038C 621 nt7.21□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 SML1YML058W 315 nt7.21□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 OST3YOR085W 1053 nt7.21□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 TFC6YDR362C 2019 nt7.2□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 HEM1YDR232W 1647 nt7.2□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 ZIM17YNL310C 525 nt7.2□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YPR076WYPR076W 375 nt7.2□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 BDF2YDL070W 1917 nt7.2□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 NUP49YGL172W 1419 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 NSE5YML023C 1671 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 DOT1YDR440W 1749 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YDR401WYDR401W 564 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 HIS1YER055C 894 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 AGX1YFL030W 1158 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 SUR7YML052W 909 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YNL092WYNL092W 1203 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 COS10YNR075W 1125 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 TMA46YOR091W 1038 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 FIT2YOR382W 462 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 EDE1YBL047C 4146 nt7.19□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 CMR1YDL156W 1569 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 TIF2YJL138C 1188 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YKR032WYKR032W 315 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 TIF1YKR059W 1188 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YOL046CYOL046C 675 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YFL052WYFL052W 1398 nt7.18□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 FZF1YGL254W 900 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 HST2YPL015C 1074 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 ICL2YPR006C 1728 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 COQ1YBR003W 1422 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 CCC2YDR270W 3015 nt7.17□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 EDC3YEL015W 1656 nt7.16□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 MIP1YOR330C 3765 nt7.16□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 ARP3YJR065C 1350 nt7.16□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 EEB1YPL095C 1371 nt7.16□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 ADE17YMR120C 1779 nt7.15□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 FBA1YKL060C 1080 nt7.15□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 SWD1YAR003W 1281 nt7.15□□□□□ -1.26
NEW1Q08972 ATF1YOR377W 1578 nt7.15□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 OPT1YJL212C 2400 nt7.14□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 AGP2YBR132C 1791 nt7.14□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 SES1YDR023W 1389 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 NPL6YMR091C 1308 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 PPH21YDL134C 1110 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 HEM2YGL040C 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 KSH1YNL024C-A 219 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 LGE1YPL055C 999 nt7.13□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 PRP2YNR011C 2631 nt7.12□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.12□□□□□ -1.27
NEW1Q08972 GAA1YLR088W 1845 nt7.12□□□□□ -1.27
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