Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN2Q02246 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTN2Q02246 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTN2Q02246 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms