Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC1P62191 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMC1P62191 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMC1P62191 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms