Protein–RNA interactions for Protein: P61978

HNRNPK, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPKP61978 AGO2-202ENST00000517293 422 ntTSL 36.78□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.581e-11■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 HSPG2-214ENST00000635682 921 ntTSL 514.79□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 211.16□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 310.01□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 31.1
HNRNPKP61978 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 517.04■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 31
HNRNPKP61978 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 517.01■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 31
HNRNPKP61978 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-8■■■■■ 31
HNRNPKP61978 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 31
HNRNPKP61978 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 31
HNRNPKP61978 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 514.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 31
HNRNPKP61978 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 219.45■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-209ENST00000507665 1143 ntTSL 26.7□□□□□ -1.342e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.442e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.572e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.732e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-205ENST00000504472 588 ntTSL 44.15□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-210ENST00000511644 686 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 EIF4E-211ENST00000515638 738 ntTSL 52.97□□□□□ -1.932e-11■■■■■ 31
HNRNPKP61978 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)23.27■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)23.24■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-213ENST00000506001 583 ntTSL 319.25■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-218ENST00000514424 584 ntTSL 412.11□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 311.39□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 38.06□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 30.9
HNRNPKP61978 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.242e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 222.73■■□□□ 1.232e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-211ENST00000494437 976 ntTSL 318.77■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 516.15■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)13.93□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 213.19□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 28.39□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AP3D1-207ENST00000589369 618 ntTSL 317.3■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 210.79□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AP3D1-205ENST00000586370 911 ntTSL 27.25□□□□□ -1.257e-8■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 NEU1-208ENST00000491768 1875 ntTSL 518.41■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 NEU1-207ENST00000480384 2214 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 NEU1-209ENST00000495807 4616 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-9■■■■■ 30.8
HNRNPKP61978 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 417.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 GRAP2-203ENST00000420971 568 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46.43□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 NOC4L-202ENST00000535343 669 ntTSL 316.38■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.679e-14■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 09e-14■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.229e-14■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 INPPL1-210ENST00000541303 1238 ntTSL 211.44□□□□□ -0.589e-14■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 INPPL1-205ENST00000537755 535 ntTSL 411.44□□□□□ -0.589e-14■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 FOXN3-217ENST00000557572 513 ntTSL 33.23□□□□□ -1.899e-7■■■■■ 30.7
HNRNPKP61978 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 547 ntTSL 512.6□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 30.6
HNRNPKP61978 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 512.45□□□□□ -0.427e-8■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.377e-8■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)21.62■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 30.5
HNRNPKP61978 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 15,354 protein–RNA pairs in 540.7 ms