RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340301.5

PKD1P6-NPIPP1-201, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1P6-NPIPP1, Length 547 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.58■■■□□ 2.49
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PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ABCC9O60706 1549 aa26.75■■□□□ 1.87
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.69■■□□□ 1.7
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.64■■□□□ 1.7
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 NACADO15069 1562 aa25.64■■□□□ 1.69
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.29■■□□□ 1.64
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.11■■□□□ 1.61
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.89■■□□□ 1.58
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SCRIBQ14160 1630 aa24.86■■□□□ 1.57
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.63■■□□□ 1.53
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.61■■□□□ 1.53
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.19■■□□□ 1.46
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SMARCA4P51532 1647 aa23.76■■□□□ 1.39
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 NCAPD3P42695 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SMARCA2P51531 1590 aa23.63■■□□□ 1.37
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 HMGXB3Q12766 1538 aa23.53■■□□□ 1.36
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 NESP48681 1621 aa23.11■■□□□ 1.29
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ERCC6Q03468 1493 aa23.08■■□□□ 1.29
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.05■■□□□ 1.28
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CUX2O14529 1486 aa22.85■■□□□ 1.25
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.84■■□□□ 1.25
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.79■■□□□ 1.24
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.71■■□□□ 1.23
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.66■■□□□ 1.22
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 PRDM2Q13029 1718 aa22.65■■□□□ 1.22
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 WDR62O43379 1518 aa22.58■■□□□ 1.21
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TOPBP1Q92547 1522 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ABCC8Q09428 1581 aa22.33■■□□□ 1.16
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.29■■□□□ 1.16
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.24■■□□□ 1.15
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 IFT140Q96RY7 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CUX1P39880 1505 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.07■■□□□ 1.12
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SOGA1O94964 1423 aa22.05■■□□□ 1.12
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.03■■□□□ 1.12
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.117e-6■■□□□ 13.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 WDR97A6NE52 1622 aa21.91■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TOP2BQ02880 1626 aa21.91■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.91■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 OSCARQ8IYS5 282 aa21.9■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SYNJ1O43426 1573 aa21.9■■□□□ 1.1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 GRIN2BQ13224 1484 aa21.8■■□□□ 1.08
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.79■■□□□ 1.08
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.78■■□□□ 1.08
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CHD1O14646 1710 aa21.77■■□□□ 1.08
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 FBLN2P98095 1184 aa21.77■■□□□ 1.08
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.77■■□□□ 1.07
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 PBRM1Q86U86 1689 aa21.75■■□□□ 1.07
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SYNJ2O15056 1496 aa21.66■■□□□ 1.06
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.59■■□□□ 1.05
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ADAMTS12P58397 1594 aa21.57■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.55■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ARHGEF11O15085 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.52■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 TRIM41Q8WV44 630 aa21.52■■□□□ 1.04
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 GRIN2AQ12879 1464 aa21.52■■□□□ 1.03
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 KIF27Q86VH2 1401 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 IGF1RP08069 1367 aa21.42■■□□□ 1.02
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 NUP160Q12769 1436 aa21.41■■□□□ 1.02
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CEP170Q5SW79 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CUL7Q14999 1698 aa21.38■■□□□ 1.01
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.36■■□□□ 1.01
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 ARAP1Q96P48 1450 aa21.35■■□□□ 1.01
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.31■■□□□ 1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.27■■□□□ 1
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 SHROOM2Q13796 1616 aa21.26■□□□□ 0.99
PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 JPH4Q96JJ6 628 aa21.22■□□□□ 0.99
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