Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UFM1P61960 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFM1P61960 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFM1P61960 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFM1P61960 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFM1P61960 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFM1P61960 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFM1P61960 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFM1P61960 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFM1P61960 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFM1P61960 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFM1P61960 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFM1P61960 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFM1P61960 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFM1P61960 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFM1P61960 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFM1P61960 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFM1P61960 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFM1P61960 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UFM1P61960 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UFM1P61960 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFM1P61960 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFM1P61960 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFM1P61960 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFM1P61960 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFM1P61960 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFM1P61960 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFM1P61960 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFM1P61960 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFM1P61960 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFM1P61960 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFM1P61960 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFM1P61960 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFM1P61960 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFM1P61960 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFM1P61960 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UFM1P61960 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFM1P61960 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFM1P61960 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms