Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H2P55055 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H2P55055 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H2P55055 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H2P55055 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms