Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UTRNP46939 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UTRNP46939 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UTRNP46939 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UTRNP46939 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UTRNP46939 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UTRNP46939 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UTRNP46939 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UTRNP46939 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UTRNP46939 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UTRNP46939 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UTRNP46939 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
UTRNP46939 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UTRNP46939 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UTRNP46939 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UTRNP46939 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UTRNP46939 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UTRNP46939 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UTRNP46939 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UTRNP46939 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UTRNP46939 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UTRNP46939 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UTRNP46939 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UTRNP46939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UTRNP46939 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UTRNP46939 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UTRNP46939 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UTRNP46939 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UTRNP46939 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UTRNP46939 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UTRNP46939 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UTRNP46939 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
UTRNP46939 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UTRNP46939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UTRNP46939 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UTRNP46939 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UTRNP46939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UTRNP46939 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
UTRNP46939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UTRNP46939 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UTRNP46939 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UTRNP46939 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UTRNP46939 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UTRNP46939 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UTRNP46939 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UTRNP46939 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UTRNP46939 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UTRNP46939 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UTRNP46939 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UTRNP46939 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UTRNP46939 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UTRNP46939 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UTRNP46939 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UTRNP46939 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
UTRNP46939 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UTRNP46939 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
UTRNP46939 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UTRNP46939 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
UTRNP46939 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UTRNP46939 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UTRNP46939 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UTRNP46939 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UTRNP46939 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UTRNP46939 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UTRNP46939 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms