Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.77■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
RANGAP1P46060 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
RANGAP1P46060 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
RANGAP1P46060 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RANGAP1P46060 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms