Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RXRBP28702 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRBP28702 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RXRBP28702 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRBP28702 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RXRBP28702 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RXRBP28702 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RXRBP28702 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RXRBP28702 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RXRBP28702 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RXRBP28702 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RXRBP28702 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RXRBP28702 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RXRBP28702 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RXRBP28702 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RXRBP28702 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RXRBP28702 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RXRBP28702 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RXRBP28702 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RXRBP28702 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RXRBP28702 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RXRBP28702 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RXRBP28702 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RXRBP28702 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RXRBP28702 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RXRBP28702 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRBP28702 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RXRBP28702 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RXRBP28702 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RXRBP28702 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RXRBP28702 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RXRBP28702 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RXRBP28702 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RXRBP28702 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RXRBP28702 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RXRBP28702 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RXRBP28702 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RXRBP28702 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RXRBP28702 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRBP28702 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRBP28702 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRBP28702 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRBP28702 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRBP28702 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RXRBP28702 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RXRBP28702 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RXRBP28702 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RXRBP28702 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RXRBP28702 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RXRBP28702 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RXRBP28702 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RXRBP28702 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RXRBP28702 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RXRBP28702 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RXRBP28702 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RXRBP28702 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RXRBP28702 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RXRBP28702 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RXRBP28702 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RXRBP28702 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RXRBP28702 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRBP28702 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRBP28702 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRBP28702 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRBP28702 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRBP28702 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RXRBP28702 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RXRBP28702 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RXRBP28702 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RXRBP28702 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms