Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS4Y1P22090 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4Y1P22090 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4Y1P22090 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4Y1P22090 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms