Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSP16219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSP16219 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSP16219 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSP16219 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSP16219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSP16219 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSP16219 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSP16219 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSP16219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSP16219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSP16219 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSP16219 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSP16219 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSP16219 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSP16219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSP16219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSP16219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADSP16219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADSP16219 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADSP16219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSP16219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSP16219 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACADSP16219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSP16219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACADSP16219 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSP16219 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACADSP16219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACADSP16219 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSP16219 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSP16219 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACADSP16219 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACADSP16219 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACADSP16219 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSP16219 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSP16219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACADSP16219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACADSP16219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSP16219 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSP16219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSP16219 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACADSP16219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSP16219 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSP16219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms