Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP4P12644 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BMP4P12644 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP4P12644 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP4P12644 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP4P12644 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP4P12644 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP4P12644 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP4P12644 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP4P12644 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP4P12644 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP4P12644 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP4P12644 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP4P12644 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP4P12644 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP4P12644 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP4P12644 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP4P12644 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP4P12644 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP4P12644 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP4P12644 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BMP4P12644 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP4P12644 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP4P12644 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP4P12644 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP4P12644 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP4P12644 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP4P12644 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP4P12644 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP4P12644 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP4P12644 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP4P12644 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP4P12644 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP4P12644 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP4P12644 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP4P12644 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP4P12644 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP4P12644 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP4P12644 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP4P12644 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP4P12644 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP4P12644 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms