Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX3O60493 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX3O60493 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX3O60493 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX3O60493 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX3O60493 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX3O60493 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX3O60493 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX3O60493 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX3O60493 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX3O60493 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX3O60493 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX3O60493 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX3O60493 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX3O60493 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX3O60493 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX3O60493 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX3O60493 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX3O60493 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX3O60493 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX3O60493 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX3O60493 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX3O60493 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX3O60493 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX3O60493 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX3O60493 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX3O60493 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX3O60493 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX3O60493 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX3O60493 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX3O60493 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX3O60493 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX3O60493 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX3O60493 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX3O60493 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX3O60493 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX3O60493 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX3O60493 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX3O60493 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX3O60493 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX3O60493 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX3O60493 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX3O60493 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX3O60493 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms