Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX1O43435 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX1O43435 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX1O43435 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX1O43435 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX1O43435 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX1O43435 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX1O43435 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX1O43435 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX1O43435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBX1O43435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBX1O43435 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TBX1O43435 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBX1O43435 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBX1O43435 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBX1O43435 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBX1O43435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBX1O43435 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBX1O43435 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBX1O43435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBX1O43435 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBX1O43435 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBX1O43435 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBX1O43435 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBX1O43435 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBX1O43435 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBX1O43435 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBX1O43435 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBX1O43435 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBX1O43435 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TBX1O43435 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBX1O43435 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBX1O43435 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBX1O43435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBX1O43435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBX1O43435 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms