Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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