Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms