RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498871.2

RGMB-AS1-201, RGMB antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RGMB-AS1, Length 1,903 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMB-AS1-201ENST00000498871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.45■■■■■ 4.55
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.28■■■■□ 3.72
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ABCC9O60706 1549 aa36.81■■■■□ 3.48
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
RGMB-AS1-201ENST00000498871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.98■■■■□ 3.35
RGMB-AS1-201ENST00000498871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.89■■■■□ 3.34
RGMB-AS1-201ENST00000498871 NACADO15069 1562 aa35.74■■■■□ 3.31
RGMB-AS1-201ENST00000498871 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.72■■■■□ 3.31
RGMB-AS1-201ENST00000498871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.62■■■■□ 3.29
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SCRIBQ14160 1630 aa35.11■■■■□ 3.21
RGMB-AS1-201ENST00000498871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.11■■■■□ 3.21
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.91■■■■□ 3.18
RGMB-AS1-201ENST00000498871 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.68■■■■□ 3.14
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.51■■■■□ 3.12
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.87■■■■□ 3.01
RGMB-AS1-201ENST00000498871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SMARCA4P51532 1647 aa33.6■■■□□ 2.97
RGMB-AS1-201ENST00000498871 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
RGMB-AS1-201ENST00000498871 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.58■■■□□ 2.97
RGMB-AS1-201ENST00000498871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.34■■■□□ 2.93
RGMB-AS1-201ENST00000498871 WIZO95785 1651 aa33.32■■■□□ 2.92
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.21■■■□□ 2.91
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.17■■■□□ 2.9
RGMB-AS1-201ENST00000498871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.15■■■□□ 2.9
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SMARCA2P51531 1590 aa33.1■■■□□ 2.89
RGMB-AS1-201ENST00000498871 NCAPD3P42695 1498 aa32.98■■■□□ 2.87
RGMB-AS1-201ENST00000498871 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
RGMB-AS1-201ENST00000498871 HMGXB3Q12766 1538 aa32.92■■■□□ 2.86
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.51■■■□□ 2.79
RGMB-AS1-201ENST00000498871 NESP48681 1621 aa32.14■■■□□ 2.74
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CFTRP13569 1480 aa32.06■■■□□ 2.72
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.05■■■□□ 2.72
RGMB-AS1-201ENST00000498871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PRDM2Q13029 1718 aa32.01■■■□□ 2.72
RGMB-AS1-201ENST00000498871 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.82■■■□□ 2.68
RGMB-AS1-201ENST00000498871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.74■■■□□ 2.67
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.69■■■□□ 2.66
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ABCC8Q09428 1581 aa31.67■■■□□ 2.66
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.6■■■□□ 2.65
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ERCC6Q03468 1493 aa31.56■■■□□ 2.64
RGMB-AS1-201ENST00000498871 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SYNJ1O43426 1573 aa31.46■■■□□ 2.63
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CUX1P39880 1505 aa31.45■■■□□ 2.62
RGMB-AS1-201ENST00000498871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
RGMB-AS1-201ENST00000498871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
RGMB-AS1-201ENST00000498871 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.4■■■□□ 2.62
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.36■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-201ENST00000498871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.36■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-201ENST00000498871 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.35■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TOPBP1Q92547 1522 aa31.35■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TOP2BQ02880 1626 aa31.34■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-201ENST00000498871 WDR62O43379 1518 aa31.32■■■□□ 2.6
RGMB-AS1-201ENST00000498871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.19■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TRIM41Q8WV44 630 aa31.17■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-201ENST00000498871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CUX2O14529 1486 aa31.07■■■□□ 2.56
RGMB-AS1-201ENST00000498871 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.05■■■□□ 2.56
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-201ENST00000498871 WDR97A6NE52 1622 aa30.98■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SOGA1O94964 1423 aa30.95■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.87■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-201ENST00000498871 IFT140Q96RY7 1462 aa30.87■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-201ENST00000498871 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.84■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.76■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-201ENST00000498871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-201ENST00000498871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-201ENST00000498871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.71■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-201ENST00000498871 KIF27Q86VH2 1401 aa30.66■■■□□ 2.5
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PBRM1Q86U86 1689 aa30.65■■■□□ 2.5
RGMB-AS1-201ENST00000498871 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
RGMB-AS1-201ENST00000498871 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
RGMB-AS1-201ENST00000498871 EEA1Q15075 1411 aa30.5■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-201ENST00000498871 IGF1RP08069 1367 aa30.49■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.48■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-201ENST00000498871 GRIN2BQ13224 1484 aa30.48■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.42■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.42■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-201ENST00000498871 ADAMTS12P58397 1594 aa30.4■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CUL7Q14999 1698 aa30.39■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-201ENST00000498871 PRXQ9BXM0 1461 aa30.33■■■□□ 2.45
RGMB-AS1-201ENST00000498871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.3■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 KIF21BO75037 1637 aa30.29■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.28■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CHD1O14646 1710 aa30.26■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.26■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-201ENST00000498871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.26■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-201ENST00000498871 SYNJ2O15056 1496 aa30.22■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-201ENST00000498871 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.16■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-201ENST00000498871 GRIN2AQ12879 1464 aa30.16■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-201ENST00000498871 FBLN2P98095 1184 aa30.12■■■□□ 2.41
RGMB-AS1-201ENST00000498871 GOLGA3Q08378 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CEP170Q5SW79 1584 aa30.06■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-201ENST00000498871 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.03■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-201ENST00000498871 NUP160Q12769 1436 aa29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms