Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRYD3Q8NCJ5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms