Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT11Q9UKZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT11Q9UKZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT11Q9UKZ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT11Q9UKZ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT11Q9UKZ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms