Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L2Q9UHA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18L2Q9UHA2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms