Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDE1Q9NXR1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDE1Q9NXR1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDE1Q9NXR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms