Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC40A1Q9NP59 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC40A1Q9NP59 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC40A1Q9NP59 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC40A1Q9NP59 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms