Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GINS4Q9BRT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS4Q9BRT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS4Q9BRT9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms