Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG1Q96Q15 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG1Q96Q15 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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