Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSKUQ8WUA8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms